Проще говоря, у Вас два пути:
1. INCLUDE_PATH во втором шаге заменить на NUKE_PATH.
2. Или в и шагах выполнять замену с учетом того, что NUKE_PATH в них должна быть заменена на INCLUDE_PATH.

ИМХО, лучше 2-й вариант... Т.е. при каждой замене (шаги: 4, 18, 19) вместо NUKE_PATH писать INCLUDE_PATH. 2-й шаг не нужно выполнять, т.к. он уже выполнен...