в файле themes/тема/theme.php
функция themesidebox() отвечает за левые и правые блоки
функции OpenTable() - CloseTable() и OpenTable2() - CloseTable2() обычно используются для размещения срдних блоков. Они кстати в некоторых случаях могут находиться в tables.php

Рассояние между новостями - копайте в функции themeindex() для главной страницы и themearticle() - для страницы с подробностями.