У меня тоже не работает, хостинг поддержывает только utf-8 хотя заливал базу на cp1251_general_ci правил добавляя как вы писали mainfile.php потом ещё добавил db.php строки:

mysql_query ("set character_set_client='cp1251'");
mysql_query ("set character_set_results='cp1251'");
mysql_query ("set collation_connection='cp1251_general_ci'");

и нечего не помогло, вот сейчас пробую в талблице править меняя кодировку лат. на cp1251_general_ci

а этот патч upgrade CHARACTER.php вообще не знаю как с ним работать??

http://ukrway.com/