GAMMA ну, быстрее открываться, это связано что сервер пошустрее работает, чем предыдущий.
Количество запросов от версии БД так же не будет зависеть, т.к. подсчет их идет до того момента как он будет отправлен в БД, и не зависит, обработает его БД ли нет.
А вот версия php может сыграть свою роль, например какое-то условие не сработать, вследствие чего выполнить (по коду) какой-либо запрос. Здесь необходимо все пересматривать в ручную и переделывать скрипты под требования 5-й версии и БД и PHP для более правильной работы.
Может, поможет найти причину включение отображение Notice