я так понел, что ты имеешь ввиду ССЫЛКИ В БЛОКЕ "НАВИГАЦИЯ".... :) - долго пытался понять тебя:) Значт так...: можно качать модули всякие и т.д. - устанавливать и они автоматом будут появляться в админке(зайди в админку - там есть такая фишка: МОДУЛИ, кликни и внизу появится их список 1модуль=1строка в БЛОКЕ НАВИГАЦИЯ(их можно включать\выключать, делать видимыми тока пользователям или только для админа и т.д.)
Если же ты хочешь просто сделать например ссылку какую-нить или на что-нить и чтоб она у тебя отображалась в главной, то просто создаёшь папку(название любое) - запихиваешь её в папку \modules и создаёшь в ней файлик index.php... куды вписываешь что те надо, согласно синтаксису пхп.... вроде всё ! :)