Поставил себе Googlifier и стал изменять все ссылки на сайте, но сайт проиндексирован в Яндексе.
Что будет, если изменяю ссылки? По ним же уже не зайти и как к этому отнесётся поисковик, не сачтёт как за что нибуть (машенничество и т.п.)?

Andruha

а где вы меняете ссылки?
по идее гуглификатор сам ссылки меняет.

Нет, я имел ввиду не это.
Например было mysite.ru/modules.php?name=Downloads, а стало mysite.ru/downloads.html
Если сайт уже проиндексирован, то поисковик будет ссылатся не на правильные ссылки.
И как на это реагирует поисковик ?

Andruha реальные ссылки попрежнему работают, поэтому поисковик найдет нужную страницу