где можно подправить запрос что бы записи в категориях сортировались по дате добавления в порядке убывания?

ищете запросы с FROM ".$prefix."_files
и в конец добавляйте ORDER BY date DESC

Добавил в этот участок кода то что было рекомендовано и вроде заработало


$sql2 = "SELECT lid, title, description, UNIX_TIMESTAMP(date) as formatted, votes, totalvotes, totalcomments, hits FROM ".$prefix."_files WHERE cid = '$cid' AND status !='0' ORDER BY date DESC limit $offset, $filenum";

Вставлять нужно везде встречается "FROM ".$prefix."_files"? Или можно ограничиться сделанным?

ещё вопрос - как доработать модуль, что бы делать выборку из базы по различным условиям? например на главной странице модуля выбираешь из списков условия, нажимаешь "найти"

Vahmurka скорее всего еще гдето будет всречаться запрос такого же плана, туда тоже нужно будет вставить, если конечно вам нужно.
знание пхп точно понадобится. Если коротко, то скрипту посредством пердача запроса get или post передается параметр где указан что сортировать, скрипт смотрит и подставляет нужное.